種子成熟度分析儀對葉綠素進行測量時是非破壞性的，通過測量種子種皮內的葉綠素發出的熒光強度，來判斷種子內的葉綠素含量高低，進而判斷種子的成熟度和種子的質量。葉綠素含量越低（葉綠素熒光強度越低），種子成熟度越高。此外還可用于檢測種子的完整性。破裂的種子會將葉綠素釋放出來，導致測得的葉綠素含量偏高。